Logiciel de comptabilité auto-entrepreneur gratuit en 2026 : comparatif complet

Pourquoi un logiciel dédié à la micro-entreprise vaut le coup, même gratuit

Un auto-entrepreneur a des obligations comptables allégées par rapport à une SARL ou une SAS. Pas de bilan, pas de compte de résultat obligatoire. Mais il doit tenir un livre des recettes, émettre des factures conformes et déclarer son chiffre d'affaires à l'URSSAF chaque mois ou chaque trimestre.

Un tableur Excel suffit techniquement. Mais il ne calcule pas vos cotisations URSSAF automatiquement, ne vous alerte pas quand vous approchez des seuils de TVA (36 800 euros pour les prestations de services), et ne génère pas les mentions légales obligatoires sur chaque facture.

Un logiciel gratuit dédié règle ces points sans effort. Le temps économisé sur une année se chiffre en heures.

• Calcul automatique des cotisations URSSAF selon votre activité (BIC ou BNC)
• Mentions légales obligatoires pré-remplies sur chaque facture
• Alerte automatique à l'approche des seuils TVA et du plafond micro-entreprise
• Export comptable pour votre expert-comptable si besoin

Indy : la référence freemium pour auto-entrepreneurs

Indy (anciennement Georges) est le logiciel de comptabilité le plus utilisé par les micro-entrepreneurs en France. La version gratuite (plan Essentiel) inclut la facturation illimitée, la synchronisation bancaire automatique et le suivi des recettes.

Ce qui distingue Indy : la synchronisation bancaire fonctionne avec la plupart des banques françaises, y compris les néobanques. Les recettes sont catégorisées automatiquement, ce qui simplifie la déclaration URSSAF.

La limite principale du plan gratuit : pas d'accès à un conseiller expert-comptable, et certaines fonctions avancées (bilan prévisionnel, gestion des notes de frais) nécessitent le plan payant à 9 euros HT par mois.

Pour aller plus loin, consultez notre comparatif des meilleurs logiciels de facturation 2026.

Henrri : 100 % gratuit sans plan premium caché

Henrri, édité par Cegid, est l'une des rares solutions où gratuit signifie vraiment gratuit. Pas de version premium, pas de fonctions verrouillées. Facturation illimitée, devis, gestion des clients, export comptable : tout est inclus sans frais.

Henrri est idéal pour les auto-entrepreneurs en prestation de services qui ont besoin d'un outil simple et fiable. L'interface est épurée, la prise en main est rapide.

Point d'attention : Henrri ne propose pas de synchronisation bancaire automatique. Le suivi de trésorerie est manuel. Pour les profils avec beaucoup de transactions, Indy ou Tiime sont plus pratiques.

Tiime : plan gratuit avec connexion expert-comptable

Tiime se distingue par son plan gratuit orienté collaboration : il permet de connecter un expert-comptable externe, qui peut consulter vos données directement depuis son propre espace Tiime.

La facturation électronique est native et conforme DGFiP, ce qui en fait un choix solide dans le contexte de la réforme 2026. Les exports comptables sont disponibles dans tous les formats standards (QuickBooks, Sage, etc.).

Le plan gratuit est cependant limité à un volume de transactions modéré. Passé ce seuil, le plan Pro à 9 euros par mois prend le relais.

Wave : puissant mais inadapté à la France

Wave est une solution américaine bien connue des entrepreneurs anglophones. La facturation et la comptabilité sont gratuites et illimitées. L'interface est soignée et les rapports financiers sont complets.

Mais Wave présente un problème majeur pour les auto-entrepreneurs français : il n'est pas agréé DGFiP pour la facturation électronique. À partir de septembre 2026, les factures émises via Wave ne seront pas conformes aux nouvelles obligations légales françaises.

Wave reste un bon choix si vous intervenez exclusivement à l'export ou pour des clients internationaux non soumis à la TVA française. Pour une activité 100 % française, préférez Indy, Henrri ou Tiime.

Comment choisir selon votre profil

Le meilleur logiciel dépend de votre volume d'activité, de votre type de prestations et de vos habitudes de travail.

Si vous avez peu de transactions par mois (moins de 10 factures), Henrri ou la version gratuite de Tiime suffisent largement. Si vous avez une activité soutenue avec de nombreuses entrées bancaires, la synchronisation automatique d'Indy vous fera gagner du temps.

Si vous travaillez avec un expert-comptable ou envisagez de le faire, Tiime facilite la collaboration directement depuis la plateforme. Si vous êtes à l'aise en anglais et que vous avez des clients internationaux, Wave reste une option fonctionnelle.

• Peu de factures, besoin simple : Henrri (100 % gratuit, sans limite de durée)
• Activité courante, synchro bancaire : Indy plan Essentiel (gratuit)
• Collaboration avec expert-comptable : Tiime plan gratuit
• Clients internationaux uniquement : Wave (attention, non conforme DGFiP en France)

Les limites des versions gratuites à connaître avant de choisir

Toutes les versions gratuites ont des limites. En les connaissant à l'avance, vous évitez les mauvaises surprises.

La limite la plus courante est le volume : certains logiciels bloquent l'accès à des fonctions avancées une fois un certain nombre de factures ou de transactions atteint. Indy par exemple limite le suivi des notes de frais et les bilans prévisionnels au plan payant.

La deuxième limite est l'accompagnement : sur les plans gratuits, le support se fait par email ou chat automatisé. L'accès à un conseiller humain nécessite généralement le plan premium.

Enfin, la conformité DGFiP pour la facturation électronique est un critère décisif en 2026. Vérifiez systématiquement que le logiciel est ou sera agréé avant d'adopter.

Quel logiciel de comptabilité est vraiment gratuit pour auto-entrepreneur en 2026 ?

Henrri est le seul logiciel 100 % gratuit sans plan premium caché pour les auto-entrepreneurs en 2026. Indy et Tiime proposent un plan gratuit avec des fonctions limitées. Wave est gratuit mais non conforme à la réforme de facturation électronique française.

Peut-on gérer sa comptabilité d'auto-entrepreneur sans logiciel ?

Oui, légalement. Un simple tableau Excel suffit pour tenir le livre des recettes obligatoire. Mais un logiciel dédié automatise le calcul des cotisations URSSAF, vérifie les mentions légales sur vos factures et vous alerte à l'approche des seuils TVA. Le temps économisé sur une année est significatif.

Quelle est la différence entre Indy et Tiime pour un auto-entrepreneur ?

Indy est plus fort sur la synchronisation bancaire automatique et la fluidité de l'interface. Tiime se distingue par la connexion directe à un expert-comptable et la conformité DGFiP native pour la facturation électronique. Les deux ont un plan gratuit. Pour une activité courante sans expert-comptable, Indy est plus pratique.

Wave est-il légal pour facturer en France en 2026 ?

Wave permet d'émettre des factures valides fiscalement, mais n'est pas agréé sur les plateformes de facturation électronique DGFiP. À partir de septembre 2026, les factures émises aux entreprises françaises devront transiter par une plateforme agréée. Wave ne répond pas à cette obligation pour les clients assujettis à la TVA en France.

À partir de quel chiffre d'affaires vaut-il mieux passer à un logiciel payant ?

La bascule se justifie autour de 30 000 à 50 000 euros de chiffre d'affaires annuel, ou dès que vous avez plus de 20 transactions bancaires par mois. À ce niveau, les fonctions avancées (bilan prévisionnel, notes de frais, export complet) et le support humain d'un plan payant rentrent dans le budget.

Comment synchroniser ma banque avec un logiciel de comptabilité gratuit ?

Indy propose la synchronisation bancaire automatique sur son plan gratuit avec la plupart des banques françaises via le protocole DSP2. Tiime propose également la synchro bancaire. Henrri ne l'inclut pas : les entrées sont saisies manuellement ou importées via fichier CSV.

Un logiciel de comptabilité peut-il remplacer un expert-comptable pour un auto-entrepreneur ?

Pour la plupart des auto-entrepreneurs, oui. Les obligations comptables d'une micro-entreprise sont limitées : livre des recettes, factures conformes, déclarations URSSAF. Un logiciel comme Indy ou Henrri gère tout cela automatiquement. Un expert-comptable devient utile si votre chiffre d'affaires approche les seuils, si vous changez de statut ou si vous avez des revenus mixtes.