Logiciel de comptabilite pour auto-entrepreneur 2026 : quel outil choisir ?

Mis à jour : 2026-06-097 min✓ Vérifié mai 2026

En tant qu auto-entrepreneur, vous avez des obligations comptables allegees par rapport a une societe. Mais vous devez tout de meme suivre vos recettes, conserver vos justificatifs et remplir votre declaration trimestrielle ou mensuelle. Un bon logiciel de comptabilite vous fait gagner du temps et reduit le risque d erreurs.

Ce que la comptabilite exige d un auto-entrepreneur

En regime micro-entreprise, vos obligations comptables sont simplifiees : vous tenez un livre des recettes, conservez vos factures et justificatifs, et declarezez votre chiffre d affaires periodiquement sur autoentrepreneur.urssaf.fr. Vous n avez pas besoin de bilan comptable ni de compte de resultat.

Un logiciel n est pas obligatoire, mais il vous fait gagner du temps sur la saisie, le suivi et la preparation de votre declaration. Il reduit aussi les risques d erreurs qui peuvent entrainer des majorations URSSAF.

  • Livre des recettes obligatoire, bilan non requis
  • Conservation des factures pendant 10 ans
  • Declaration CA sur autoentrepreneur.urssaf.fr
  • Un logiciel n est pas obligatoire mais recommande

Indy : solution francaise specialisee auto-entrepreneur

Indy (anciennement Shine Compta, maintenant independant) est specialise dans la comptabilite des independants et auto-entrepreneurs. Il se connecte a votre banque professionnelle, categorise automatiquement vos transactions, genere votre livre des recettes et vous rappelle vos echeances URSSAF.

Plan pour auto-entrepreneurs : gratuit jusqu a 10 transactions par mois, puis environ 9 EUR par mois. Simple et adapte aux besoins specifiques du regime micro.

  • Connexion bancaire et categorisation automatique
  • Rappels d echeances URSSAF
  • Plan gratuit disponible
  • Interface en francais, support francophone

Dougs : comptabilite en ligne avec expert-comptable

Dougs est un cabinet d expertise comptable en ligne. Pour les auto-entrepreneurs, il propose une solution de suivi comptable avec acces a des experts en cas de question. Plus cher qu Indy (a partir de 25 EUR par mois), mais avec un accompagnement humain inclus.

Pertinent pour les auto-entrepreneurs avec un chiffre d affaires significatif ou une activite complexe (gestion de stock, activite mixte vente/service) qui veulent etre surs de ne pas faire d erreurs.

  • Expert-comptable accessible en cas de question
  • Suivi comptable complet
  • A partir de 25 EUR par mois
  • Recommande pour CA important ou situation complexe

Freebe : tout-en-un pour les freelances

Freebe combine gestion des devis, factures et suivi comptable dans une seule plateforme. Il inclut un simulateur de revenus nets, un suivi des charges et la preparation de votre declaration URSSAF. Pratique si vous voulez tout centraliser : du devis a la comptabilite.

Prix : a partir de 9,90 EUR par mois. Bien note par les freelances pour sa simplicite d utilisation.

  • Devis, factures et comptabilite dans un seul outil
  • Simulateur de revenus nets
  • Preparation declaration URSSAF incluse
  • A partir de 9,90 EUR par mois

Excel et Google Sheets : la solution gratuite

Pour un auto-entrepreneur avec peu de transactions, un tableau Excel ou Google Sheets peut suffire. Le gouvernement propose meme des modeles de livre des recettes en ligne. L inconvenient : pas de connexion bancaire automatique, tout est saisi manuellement, et vous devez vous rappeler vous-meme de vos echeances.

Pour les debutants qui souhaitent tester leur activite avant d investir dans un outil, c est une bonne etape de depart.

  • Gratuit
  • Saisie manuelle uniquement
  • Bonne option pour demarrer ou tester
  • Modeles disponibles sur le site des Impots

Questions fréquentes